scalable minds

Was scalable minds macht

scalable minds aus Potsdam entwickelt gemeinsam mit dem Max-Planck-Institut für Hirnforschung die Open-Source-Plattform WEBKNOSSOS, mit der Forschende riesige 3D-Mikroskopiedaten im Browser betrachten und annotieren. Solche Daten entstehen etwa in der Konnektomik, die Nervenverbindungen im Gehirn kartiert, und erreichen Petabyte-Größe. Ergänzend bietet das Team KI-Auswertungen als Dienstleistung an. Nutzer sind unter anderem das Max-Planck-Institut für Hirnforschung, das Francis Crick Institute und die Brown University. ²¹

WEBKNOSSOS

Die Plattform macht Bilddaten von Gigabyte bis Petabyte im Browser zugänglich, erlaubt gemeinsames Annotieren und sicheres Teilen und eignet sich für 3D-Mikroskopie sowie MRT- und CT-Daten. Sie steht unter der AGPL-Lizenz. ²¹

Voxelytics

Die Analyse-Suite bündelt KI-Workflows für die Konnektomik: Ausrichtung von Elektronenmikroskopie-Stapeln, Segmentierung von Neuronen, Rekonstruktion von Konnektomen und Erkennung von Synapsen, optimiert für Hochleistungsrechner. ²

Dienstleistungen

Forschungsgruppen können Ausrichtung, Segmentierung, eigene KI-Modelle etwa für Organellen oder Läsionen und Annotationsarbeiten beauftragen. Dazu kommt Beratung zum Datenformat Zarr. ²

Schwerpunkte, Technologien und Branchen

Schwerpunkte

Bildanalyse für Life SciencesKonnektomik3D-Annotation

Technologien

WEBKNOSSOSDeep LearningOpen Source

Branchen

ForschungBiotechnologieGesundheit

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